+ 972547771177После более чем пяти лет и 672 образцов пациентов исследовательская группа OHSU опубликовала самый большой набор данных о раке в своем роде для лечения лейкемии. Исследование «Функциональный геномный ландшафт острого миелоидного лейкоза», опубликованное сегодня в Nature.
Острая миелоидная лейкемия, или ОМЛ, имеет низкую выживаемость: менее 25 процентов вновь диагностированных пациентов выживают более пяти лет. Разработка эффективных целенаправленных методов борьбы с отмыванием денег оказалась сложной задачей, поскольку ОМЛ не является одной болезнью, а болезнью многих типов. Следовательно, уровень обслуживания в течение последних 40 лет в значительной степени не изменился.
Для получения информации о том, как проводят лечение острого миелоидного лейкоза в Израиле лучшие специалисты страны, оставьте заявку и мы свяжемся с Вами в ближайшее время.
Брайан Друкер, доктор философии, директор Института рака яичников OHSU, был соавтором исследования и среди исследователей, которые вели работу по привлечению этих данных в исследовательские и клинические сообщества.
Друкер говорит, что это исследование - яркий пример исследования ОМЛ в рамках многоуровневого сотрудничества под названием Beat AML Initiative, спонсируемого обществом лейкемии и лимфомы. OHSU Knight онкологический институт является одним из нескольких по всей стране, ищущих новые методы лечения этой болезни.
Исследование автора Джефф Тайнер, доктора философии, говорит, что видение с самого начала проекта в 2013 году состояло в том, чтобы собрать всеобъемлющий набор данных. Тайнер и команда стремились иметь как понимание геномного секвенирования, так и молекулярный состав этих образцов и информацию о том, как опухолевые клетки реагируют на различные препараты в лабораторных исследованиях.
Имея конкретную клиническую информацию, в том числе о том, как опухолевые клетки из 409 образцов ответили на 122 различных целевых терапии, устанавливает это исследование отдельно от других наборов данных, которые были опубликованы до настоящего времени, говорит Тайнер.
«Когда у вас есть клиническая информация, которая хорошо интегрирована с информацией исследований, вы можете задать больше вопросов», - говорит он. «Скажем, врач видит пациента с ОМЛ с определенной мутацией гена. Имея информацию о скрининге в лаборатории, наш набор данных может быть полезен, чтобы определить, соответствует ли эта конкретная генная мутация определенной чувствительности к лекарственным средствам. Мы полагаем, что этот набор информации поможет исследователям и врачам решать эти конкретные вопросы легче».
При таком огромном объеме данных, полученных из этих образцов, возникает логический вопрос: как только вы получите их, как вы собираетесь поделиться им с исследовательским сообществом? Другой соавтор исследования, Шеннон Маквейни и ее команда возглавили координацию, анализ и моделирование данных для проекта. Важным вкладом в исследование стало их развитие новой платформы визуализации информации под названием Vizome.
«Наводнение высокой пропускной способности, многомерные данные потенциально могут подавить ученых и клиницистов, изолируя их от открытия знаний», - говорит Маквейни. «Это требует нового поколения научных вычислительных подходов и стратегий для управления, интеграции и визуализации данных, стимулирующих разведку. Vizome позволяет любому исследовать их».
Маквини говорит, что Vizome может помочь ускорить биомедицинский перевод и новые прорывы и новые гипотезы для понимания и лечения ОМЛ.
Совместный консорциум
Команда OHSU быстро признала вклад соавторов по всей стране. Представители 11 академических медицинских центров сыграли ключевую роль в сборе и анализе 672 образцов раковых клеток у 562 пациентов. Фармацевтические и биотехнологические компании, всего 11, внесли свой вклад в усилия, поставляя лекарства для тестирования.
«Сила консорциума помогла продвинуть проект», - говорит Тогнон. «Для достижения этой цели все работали вместе. Мы не могли бы сделать это в одиночку».
Проект иллюстрирует глубокий уровень сотрудничества, который будет необходим для достижения прогресса в борьбе с раковыми заболеваниями, которые трудно поддаются лечению в качестве ПОД / ФТ.
«У нас есть клинические испытания, начиная с сегодняшнего дня, мы начнем разрабатывать их, чтобы они проверили некоторые из наших гипотез», - говорит Тайнер. «Вы можете начать ощущать некоторое наращивание импульса с помощью новых, лучших терапевтических средств для пациентов с ОМЛ, и, надеюсь, этот набор информации поможет поднять этот импульс еще больше. Мы хотим как можно больше рассчитать эту информацию в клинических испытаниях, и мы хотим, чтобы более широкое сообщество, чтобы использовать этот набор данных для ускорения собственной работы».
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-10-involving-hundreds-patient-samples-reveal.html
