Исследователи из Йельской школы общественного здравоохранения обнаружили математические отношения, которые проливают новый свет на скорость, с которой раковые клетки мутируют и почему некоторые выживают и быстро размножаются, а другие нет.
Открытие сотрудниками лаборатории Джеффри Таунсенда, доктора философии, профессора биохимии Элиху и экологии и эволюционной биологии позволит провести необходимые вычисления, которые определяют вероятный масштаб раковых клеток по мере их развития.
Для получения информации о том, как проводят лечение рака в Израиле лучшие специалисты страны, оставьте заявку и мы свяжемся с Вами в ближайшее время.
Этот вывод имеет последствия для принятия решений об отборе и разработки клинических испытаний, разработки фармацевтических препаратов и определения приоритетов в области исследований.
Исследование опубликовано в Журнале Национального института рака.
«За последние 10 лет мы смогли рассчитать из последовательности опухолей, которые мутировали, какие гены являются сильными и, которые мутировали, помогая раку выжить и размножаться, и которые ничего не делают», - сказал Таунсенд. «Но мы не смогли вычислить насколько важна одна мутация по сравнению с другой. Теперь мы можем».
Основной целью биологии рака является не только выявление важных и несущественных генов для его развития, но и определение относительной важности каждой клеточной мутации для выживания.
Ученые оценили размеры эффекта всех повторяющихся однонуклеотидных вариантов у 22 основных видов рака и определили относительную важность каждого из них.
Исследования секвенирования опухолей обычно сообщали о том, как часто наблюдаются мутации, и статистическая мера (значение Р), указывающая на то, перегружен ли ген мутациями. Тем не менее, ни одна из мер не является эффектом для рака. Ни одна из этих мер не сообщает о том, насколько важен ген для опухолеобразования и онкологических заболеваний. Чтобы количественно оценить размер рака, Таунсенд и его коллеги нарушили частоту, когда мутация наблюдается в опухолях на два фактора: базовую скорость мутации и степень отбора мутации в линии рака. Как мутация, так и селекция способствуют частоте вариантов среди клеток. Таунсенд и его коллеги смогли использовать разнообразные данные о масштабах генома для расчета скорости мутации. По существу, разделив вклад мутации с частоты, в которой наблюдались мутации в опухолях, они показали, как рассчитать размер эффекта рака.
Таунсенд заимствует прорыв к прозрениям, которые исходят из истории эволюционной биологии. «В то время как в мире рака основное внимание уделялось частотам мутаций, основное внимание в эволюционной биологии было связано с процессом естественного отбора на эти мутации. Количественная оценка размеров рака является отличным примером того, как междисциплинарные исследования не только полезны, но необходимо для научного прогресса», - сказал он.
Почему размер эффекта рака важен? Таунсенд использует пример опухоли, из которой последовательность ДНК показывает, что два гена, которые, как известно, связаны с раком, мутировали. Существует два высокоэффективных препарата, нацеленных на эти точные мутации, но для их сравнения не проводилось клинических испытаний.
«Рассматривая рак через объектив эволюции, мы можем использовать богатство молекулярных данных, доступное через секвенирование ДНК опухоли, чтобы лучше понять, что такое рак, а также расширить и усовершенствовать эволюционную теорию», - говорит Винсент Каннатаро, доктор философии.
Источник: https://medicalxpress.com/news/2018-10-cancerous-cells-ysph.html