Ученые из Детской исследовательской больницы св. Иуды обнаружили несколько новых подтипов наиболее распространенного рака у детей. Результаты их работы могут улучшить диагностику и лечение пациентов из группы высокого риска.

Исследователи использовали интегрированный анализ генома, включающий в себя РНК-секвенирование, чтобы определить геномный ландшафт В-клеточного острого лимфобластного лейкоза (В-ОМЛ) почти у 2000 детей и взрослых. В-ОЛЛ является самой распространенной формой рака у детей. Он остается основной причиной смерти от злокачественных заболеваний среди маленьких пациентов.

Для получения информации о том, как проводят лечение лейкоза в Израиле лучшие специалисты страны, оставьте заявку и мы свяжемся с Вами в ближайшее время.

Ученые идентифицировали 23 подтипа В-ОЛЛ, В том числе восемь новых подтипов, с различными геномными и клиническими особенностями, а также клиническими исходами. Распространенность того или иного подтипа часто изменяется с возрастом. Более 90% случаев В-ОЛЛ теперь можно классифицировать по подтипам, по сравнению с 70% несколько лет назад.

«В-ОЛЛ обладает потрясающим молекулярным разнообразием, которые мы использовали для уточнения классификации и разработки прецизионных лекарств, чтобы улучшить лечение и клинические исходы

Результаты исследования были опубликованы в журнале «Nature Genetics».

Изменения, определяющие подтип

Изменения гена фактора транскрипции  PAX5 определили два новых подтипа, включая PAX5 P80R, в качестве первичного лимфобластного лейкоза, инициированного точечной мутацией. «Хотя вторичные мутации необходимы и часто включают передачу сигналов киназы, мы показали, что эта точечная мутация ухудшает развитие В-лимфоидных клеток и способствует развитию В-ОЛЛ у мышей» - отметили ученые.

Другой подтип PAX5, измененный PAX5, был определен различными изменениями в гене, включающими мутации секвенирования или перестройки с одним из 24 генов. Вместе подтипы PAX5 составляли 10% ранее неклассифицированных случаев В-ОЛЛ.

Новые подтипы включают в себя разновидности В-ОЛЛ высокого риска, которые встречаются в основном у взрослых.они определялись перестройкой транскрипционных факторов BCL2 с MYC или BCL6 « У этого подтипа мрачные прогнозы. Распознавание подтип-определяющей перестройки может привести к разработке альтернативной терапии для пациентов» - отметили ученые.

В то же время, подтип, определяемый перестройкой DUX4, ассоциировался с хорошим прогнозом у взрослых и детей.

Отслеживание экспрессии генов

Исследование продемонстрировало способность РНК-секвенирования идентифицировать множественные типы геномных изменений, что подчеркивает пользу этого метода для диагностики лейкемии, когда секвенирование всего генома недоступно.

«Благодаря нашей работе две трети пациентов с В-ОЛЛ, которые ранее не были охарактеризованы, могут быть классифицированы на различные подтипы с разными профилями генетических изменений и клиническими особенностями. Это может существенно ускорить разработку индивидуальных методов лечения этих людей» - отметили исследователи.

«Мы также создали надежный классификационный конвейер B-ОЛЛ, основанный на данных секвенирования РНК, которые могут быть интегрированы в клиническую диагностику ОЛЛ» -добавили ученые.

Новые данные, описывающие разнообразие подтипов В-ОЛЛ, позволят ученым улучшитьть прогнозирование заболевания для некоторых пациентов и, в конечном итоге, приведут к разработке таргетных методов лечения, которые будут эффективно лечить лейкоз с меньшим количеством побочных эффектов.

Обнаружены дополнительные подтипы

Другие новые идентифицированные подтипы включают в себя:

  • Перестройка гена NUTM1 с различными генами-партнерами, которые, по мнению исследователей, могут быть уязвимы для терапии;
  • Перестройка гена HLF на множественные гены, включая TCF4, а также ранее признанного «партнера» TCF3;
  • Три подтипа, которые имеют общие паттерны экспрессии генов, аналогичные установленным подтипам B-ОЛЛ. Классификация предполагает, что новые подтипы, ETV6-RUNX1-подобные, KMT2A-подобные и ZNF384-подобные, имеют профили риска и прогнозы, аналогичные установленному подтипу, соответственно которому они названы;
  • Дополнительные подтипы, управляемые мутациями последовательности, в том числе IKZF1 N159Y. Мутации IKZF1 (Ikaros) являются маркером B-ОЛЛ высокого риска.

Источник: https://www.sciencedaily.com/releases/2019/01/190114113514.htm

Дата публикации: 
вторник, января 15, 2019